Wejście do Jaskini Maltańskiej znajduje się na Malcie.
W małej wiosce Casal Paula w 1902 r. robotnicy, którzy kopali studnię, dosłownie wpadli pod ziemię . Po raz kolejny odkryli zewnętrzne pomieszczenie wejścia do Jaskini Maltańskiej. Ponieważ studnia miała zostać wykopana dla domu, który znajdował się przy głównej ulicy o nazwie „Hal Saflieni”, a ponieważ ta pierwsza jaskinia została później odkryta jako zespół jaskiń, z których trzy były serią komór wykopanych w litej skale na trzy jeszcze niższe poziomy dla każdej komory, wejście to jest znane jako „Hypogeum of Hal Saflienti”. Hypogeum to łacińska nazwa podziemnej konstrukcji.
Później odkryto, że ta seria podziemnych pomieszczeń znajdowała się w środku starożytnej neolitycznej wioski. Z konstrukcji kamieni wejściowych przyjmuje się obecnie, że w pewnych momentach przed wejściem bywała przykuta łańcuchami ofiara z ludzi. Okazało się, że wejście oraz ściany i sufity niektórych korytarzy i pomieszczeń są ozdobione prymitywnymi projektami artystycznymi w kolorze czerwonej ochry , ale kiedy zostały odkryte, trzy jaskinie były wypełnione aż 30 000 szkieletami mężczyzn, kobiet i dzieci . Po usunięciu wszystkich tych kości odkryto prymitywne malowidła ścienne.
Legenda głosi, że te przejścia kiedyś łączyły się z podziemnymi kryptami, z których powstały rzymskie katakumby. To może być prawdą; bo Morze Śródziemne zostało stworzone po czasach neolitu przez trzęsienia ziemi i przemieszczanie się skorupy ziemskiej. Dlatego, chociaż starożytne tunele mogły istnieć, mogły zostać zamknięte przez tego typu kataklizmy, a wiedza o nich dotarła do nas tylko w legendach.
Tunele pod „Hypogeum” zostały zamknięte, odkąd nauczyciel w szkole zabrał 30 uczniów do jaskiń i zniknął, przewodnik i wszyscy. Stwierdzono, że zawaliły się na nich ściany. Grupy poszukiwawcze nigdy nie były w stanie zlokalizować żadnego śladu tych ludzi.