Aminokwasy to monomery, które zawierają w swojej budowie dwie grupy funkcyjne:
 grupę aminową (NH2) – tzw. N-koniec
oraz grupę karboksylową – tzw. C-koniec.

Jest 20 rodzajów aminokwasów budujących białka.
Wszystkie te aminokwasy zbudowane są z atomów węgla, wodoru, tlenu i azotu.

Są również aminokwasy, które w swej budowie posiadają atom siarki – aminokwasy siarkowe.
Należą do nich metionina, cystyna i cysteina.

Wiązanie peptydowe powstaje między grupą aminową jednego aminokwasu i grupą karboksylową drugiego aminokwasu, dając peptyd. Dipeptydy zbudowane są z dwóch cząsteczek aminokwasów.
Polipeptydy zawierają trzy i powyżej cząsteczek aminokwasów ułożonych w łańcuchy.

W typowym aminokwasie centralnie położony atom węgla alfa - C jest połączony z I-rzędową grupą aminową - NH2 grupą karboksylową - COOH i łańcuchem bocznym -R.
Prolina jest wyjątkiem, ponieważ zawiera II-rzędową grupę aminową.

Podział aminokwasów:
Aminokwasy możemy podzielić na egzogenne i endogenne.  
Kryterium tego podziału jest to czy dany aminokwasy jest syntezowany przez organizm człowieka, czy należy dostarczyć go wraz z pokarmem.

Aminokwasy endogenne - są to aminokwasy, które mogą być syntezowane przez organizm człowieka.
Jest ich 12 .
Aminokwasy endogenne dla człowieka to:
alanina Ala
glicyna Gly
prolina Pro
asparagina Asn
kwas asparaginowy Asp
kwas glutaminowy Glu
glutamina Gln
cysteina Cys
seryna Ser

Aminokwasy względnie egzogenne - są to aminokwasy, które mogą być syntetyzowane przez człowieka z innych aminokwasów egzogennych.
Te aminokwasy powinno się dostarczać do organizmu, ponieważ w niektórych stanach, np. niewłaściwa dieta, ich sytetyzowanie może być niewystarczające dla organizmu.
Są to:

arginina Arg- w cyklu ornitynowym wytwarzana z ornityny, egzogenna dla dzieci
tyrozyna Tyr - wytwarzana z fenyloalaniny
histydyna His - wytwarzana podczas przemian zasad purynowych, egzogenna dla dzieci i kulturystów (duży przyrost masy)

Aminokwasy egzogenne - muszą być dostarczane systematycznie wraz z pożywieniem.
Jest ich 8. Dla dorosłego człowieka aminokwasy egzogenne to:

fenyloalanina Phe
izoleucyna Ile
leucyna Leu
metionina Met
Treonina Thr
lizyna Lys
tryptofan Trp
walina Val

Aminokwasy naturalne, niebiałkowe: wytwarzane są w organizmach żywych.
Aminokwasy niebiałkowe mogą wchodzić w skład peptydów, ale nie można ich uzyskać hydrolizując białka.

Do aminokwasów niebiałkowych należą:
hydroksyprolina- obecna jest w kolagenie ( stabilizuje go w tkance łącznej, kościach),
ornityna,
cytrulina- obecne w cyklu mocznikowym,
karnityna- uczestniczy w transporcie kwasów tłuszczowych przez błonę mitochondrialną.

Aminokwasy kontaktowe:
Aminokwasy kontaktowe są to aminokwasy znajdujące się w centrum aktywnym enzymu. To najbardziej reaktywne aminokwasy. Aminokwasy kontaktowe- przykłady:

kwas asparaginowy ( -COOH)
kwas glutaminowy (-COOH)
lizyna (-NH2)
histydyna seryna (-OH)
treonina (-OH)
cysteina (-SH)

Aminy - arylowe i alkilowe pochodne amoniaku:
Aminy biogenne powstają jako produkty rozkładu aminokwasów, które wchodzą w skład białek. Powstają na skutek dekarboksylacji aminokwasów. Mogą być bardzo toksyczne i wykazywać silne działanie fizjologiczne.

Aminy biogenne- przykłady:
putrescyna - powstaje z ornityny,
kadaweryna - powstaje z lizyny,
tyramina - powstaje z tyrozyny,
histamina - powstaje z histydyny, gomadzi się w zepsutym mięsie ryb jako efekt działania enzymów bakteryjnych.
Wysokie stężenia histaminy z mięsie ryby może powodować poważne zatrucie organizmu. Histamina pełniąc funkcje hormonu stymuluje skurcz mięśni gładkich oraz wydzielanie śluzu.

tryptamina - powstaje z tryptofanu,
cysteamina - powstaje z cysteiny ( jest składnikiem CoA) .

Neurotransmitery = katecholoaminy

Katecholoaminy są to pochodne tyrozyny.
Adrenalina to hormon wytwarzany w części rdzeniowej nadnerczy, stymuluje rozkład glikogenu w mięśniach.
Adrenalina często stosowana jest podczas terapii odchudzających ze względu na to ,że powoduje zahamowanie łaknienia i przyspiesza tempo spalania tkanki tłuszczowej. Adrenalina pobudza i odpowiedzialan jest za reakcje 'walcz lub uciekaj'- dzięki działaniu adrenaliny organizm człowieka jest w stanie podjąć bardzo duży wysiłek fizyczny. Podwyższa ciśnienie krwi, uwalnia się w sytuacjach podwyższonego stresu. Może prowadzić do zaburzeń w metabolizmie glukozy. :)